Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb5O70309 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb5O70309 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb5O70309 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms