Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Foxq1O70220 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxq1O70220 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxq1O70220 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms