Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mmp8O70138 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp8O70138 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp8O70138 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms