Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd70O55237 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd70O55237 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms