Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Supt5hO55201 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Supt5hO55201 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Supt5hO55201 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms