Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl35aO55142 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rpl35aO55142 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl35aO55142 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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