Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrxO55103 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrxO55103 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PrxO55103 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrxO55103 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrxO55103 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrxO55103 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PrxO55103 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrxO55103 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrxO55103 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrxO55103 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrxO55103 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrxO55103 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrxO55103 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrxO55103 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrxO55103 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrxO55103 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrxO55103 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrxO55103 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrxO55103 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrxO55103 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrxO55103 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrxO55103 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PrxO55103 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrxO55103 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrxO55103 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrxO55103 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrxO55103 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms