Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trappc3O55013 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3O55013 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms