Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bnip3O55003 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnip3O55003 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnip3O55003 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms