Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlkO54988 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlkO54988 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SlkO54988 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SlkO54988 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SlkO54988 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SlkO54988 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SlkO54988 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlkO54988 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlkO54988 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms