Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole2O54956 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole2O54956 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms