Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr1i2O54915 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr1i2O54915 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nr1i2O54915 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms