Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf12O54907 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms