Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itgb3O54890 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb3O54890 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms