Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TsksO54887 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TsksO54887 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TsksO54887 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TsksO54887 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TsksO54887 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TsksO54887 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TsksO54887 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsksO54887 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsksO54887 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsksO54887 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TsksO54887 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TsksO54887 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsksO54887 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsksO54887 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsksO54887 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsksO54887 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TsksO54887 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TsksO54887 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TsksO54887 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TsksO54887 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TsksO54887 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TsksO54887 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TsksO54887 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TsksO54887 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TsksO54887 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TsksO54887 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TsksO54887 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms