Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csnk2a2O54833 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a2O54833 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms