Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DffaO54786 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DffaO54786 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DffaO54786 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DffaO54786 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DffaO54786 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DffaO54786 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DffaO54786 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DffaO54786 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DffaO54786 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DffaO54786 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DffaO54786 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DffaO54786 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DffaO54786 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DffaO54786 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DffaO54786 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DffaO54786 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DffaO54786 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DffaO54786 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DffaO54786 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DffaO54786 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DffaO54786 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DffaO54786 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DffaO54786 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DffaO54786 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DffaO54786 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DffaO54786 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms