Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek2O35942 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nek2O35942 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek2O35942 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek2O35942 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek2O35942 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek2O35942 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek2O35942 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms