Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpibO35906 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpibO35906 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpibO35906 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpibO35906 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpibO35906 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpibO35906 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpibO35906 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpibO35906 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpibO35906 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpibO35906 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpibO35906 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpibO35906 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpibO35906 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpibO35906 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SpibO35906 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpibO35906 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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