Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NudcO35685 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NudcO35685 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NudcO35685 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NudcO35685 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NudcO35685 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NudcO35685 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NudcO35685 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NudcO35685 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NudcO35685 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NudcO35685 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NudcO35685 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NudcO35685 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NudcO35685 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NudcO35685 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NudcO35685 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NudcO35685 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NudcO35685 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NudcO35685 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NudcO35685 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NudcO35685 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NudcO35685 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NudcO35685 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NudcO35685 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.5 ms