Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stag2O35638 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag2O35638 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag2O35638 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stag2O35638 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms