Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Edil3O35474 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Edil3O35474 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Edil3O35474 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms