Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrcpO35427 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrcpO35427 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrcpO35427 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrcpO35427 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms