Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc1O35379 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc1O35379 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Abcc1O35379 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Abcc1O35379 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Abcc1O35379 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Abcc1O35379 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Abcc1O35379 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Abcc1O35379 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Abcc1O35379 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms