Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pkd2O35245 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Pkd2O35245 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pkd2O35245 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms