Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Smad6O35182 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad6O35182 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad6O35182 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad6O35182 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms