Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Polr1aO35134 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Polr1aO35134 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Polr1aO35134 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Polr1aO35134 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Polr1aO35134 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Polr1aO35134 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Polr1aO35134 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Polr1aO35134 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms