Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sprr3O09116 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr3O09116 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms