Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Dctn1O08788 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dctn1O08788 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dctn1O08788 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms