Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nfil3O08750 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfil3O08750 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfil3O08750 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms