Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Barx2O08686 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Barx2O08686 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms