Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
U90926O08546 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
U90926O08546 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
U90926O08546 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
U90926O08546 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
U90926O08546 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
U90926O08546 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms