Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efna5O08543 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna5O08543 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efna5O08543 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms