Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfpl4bJ3QPR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfpl4bJ3QPR6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms