Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms