Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21972J3QN38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21972J3QN38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms