Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp616J3QN14 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp616J3QN14 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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