Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E030018B13RikJ3QMS9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms