Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21969J3QJZ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm21969J3QJZ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21969J3QJZ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms