Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubgcp6G5E8P0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tubgcp6G5E8P0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubgcp6G5E8P0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms