Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r34G3XA52 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r34G3XA52 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms