Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf148G3X9R7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf148G3X9R7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms