Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
2610008E11RikG3X964 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2610008E11RikG3X964 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2610008E11RikG3X964 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms