Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zkscan2G3X952 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zkscan2G3X952 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zkscan2G3X952 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms