Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx1-1G3UXB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx1-1G3UXB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms