Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r39G3UWE6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r39G3UWE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms