Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r167G3UW71 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms