Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubap1lG3UW59 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubap1lG3UW59 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubap1lG3UW59 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms