Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn34aG3UW52 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn34aG3UW52 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms