Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20604F8WIA3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20604F8WIA3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms